南京港位于長(cháng)江下游，是江蘇省省會(huì )南京市的水上門(mén)戶(hù)，水路距長(cháng)江入?？?47千米，是江海相通的對外輪開(kāi)放的內河第一大港，為我國南北交通、江海運輸、水陸換裝的重要樞組。該港水域上界為慈湖河口與烏江河口連線(xiàn)；下界為新河口標與十二圩河口連線(xiàn)，長(cháng)約98千米。

南京港水域由長(cháng)江港口和內河港口兩部分組成。長(cháng)江港口主要包括長(cháng)江大橋以下以江海轉運為主的新生圩、龍潭、馬渡、西壩、儀征港區；長(cháng)江大橋以上以江內轉運為主的銅井、七壩港區；為南京工業(yè)基地服務(wù)的板橋、棲霞、大廠(chǎng)臨港工業(yè)港區；為城市物資運輸服務(wù)的浦口、梅子洲、下關(guān)、上元門(mén)港區。內河港口包括高淳、江寧、溧水、六合、浦口及雨花臺6個(gè)港區。

新生圩港區位于長(cháng)江南岸，自執法基地下至南煉1號碼頭上，以外貿物資運輸為主，并具有商品汽車(chē)滾裝運輸功能?，F有生產(chǎn)性泊位35個(gè)（萬(wàn)噸級及以上12個(gè)），年通過(guò)能力1959萬(wàn)噸，碼頭核定最大靠泊8萬(wàn)噸級。

龍潭港區位于長(cháng)江南岸，自七鄉河口至西氣東輸管道上，岸線(xiàn)10千米，主要以集裝箱和大宗散貨運輸為主?，F有生產(chǎn)性泊位40個(gè)（萬(wàn)噸級及以上12個(gè)），年通過(guò)能力4096萬(wàn)噸。

馬渡港區位于長(cháng)江南岸，自西氣東輸管道至大道河口，以大宗散貨和通用雜貨為主，主要服務(wù)于后方臨港產(chǎn)業(yè)?，F有生產(chǎn)性泊位2個(gè)（萬(wàn)噸級及以上12個(gè)），年通過(guò)能力1959萬(wàn)噸，碼頭核定最大靠泊8萬(wàn)噸級。

龍潭港區位于長(cháng)江南岸，自七鄉河口至西氣東輸管道上，岸線(xiàn)10千米，主要以集裝箱和大宗散貨運輸為主?，F有生產(chǎn)性泊位40個(gè)（萬(wàn)噸級及以上2個(gè)），年通過(guò)能力4096萬(wàn)噸。

馬渡港區位于長(cháng)江南岸，自西氣東輸管道至大道河口，以大宗散貨和通用雜貨為主，主要服務(wù)于后方臨港產(chǎn)業(yè)?，F有生產(chǎn)性泊位2個(gè)（萬(wàn)噸級及以上1個(gè)），年通過(guò)能力375萬(wàn)噸。

西壩港區位于長(cháng)江北岸，從通江集上游至長(cháng)江四橋上，主要以液體化工品和散雜貨運輸為主，為后方石化工業(yè)園區及江北地區物資運輸提供服務(wù)。西壩港區包括西壩和通江集兩個(gè)作業(yè)區?，F有生產(chǎn)性泊位17個(gè)（萬(wàn)噸級及以上8個(gè)），年通過(guò)能力1911萬(wàn)噸。

儀征港區位于長(cháng)江北岸，自長(cháng)江四橋下至泗源溝，以石油化工品運輸為主，主要服務(wù)于后方化工園區及長(cháng)江中上游地區?，F有生產(chǎn)性泊位17個(gè)（萬(wàn)噸級及以上6個(gè)），年通過(guò)能力2152萬(wàn)噸，碼頭核定最大靠泊8萬(wàn)噸級。

銅井港區位于長(cháng)江南岸，自慈湖河口至新民船廠(chǎng)下，主要以散雜貨運輸為主，服務(wù)于江寧開(kāi)發(fā)區及馬鞍山地區?，F有生產(chǎn)性泊位9個(gè)，年通過(guò)能力207萬(wàn)噸。

七壩港區位于長(cháng)江北岸，自烏江河口至板橋汽渡下1.5千米，主要以散雜貨運輸為主，服務(wù)于后方浦口經(jīng)濟技術(shù)開(kāi)發(fā)區、江北及周邊地區?，F有生產(chǎn)性泊位3個(gè)，年通過(guò)能力144萬(wàn)噸。

板橋港區位于長(cháng)江南岸，自新民船廠(chǎng)下至華潤熱電碼頭下，港口岸線(xiàn)7.3千米，主要為鋼鐵、電力等企業(yè)原材料、成品運輸服務(wù)?，F有生產(chǎn)性泊位36個(gè)（萬(wàn)噸級及以上2個(gè)），年通過(guò)能力3023萬(wàn)噸。

棲霞港區位于長(cháng)江南岸，自南煉1號碼頭上至七鄉河口，港口岸線(xiàn)3.1千米，主要為南煉等大型企業(yè)為主的臨港工業(yè)發(fā)展服務(wù)?，F有生產(chǎn)性泊位29個(gè)（萬(wàn)噸級及以上8個(gè)），年通過(guò)能力1326萬(wàn)噸。

大廠(chǎng)港區位于長(cháng)江北岸八卦洲左漢，自石頭河口至通江集上游，港口岸線(xiàn)12.7千米，主要為鋼鐵、石化、電力等臨港企業(yè)物資運輸服務(wù)?，F有生產(chǎn)性泊位54個(gè)（萬(wàn)噸級及以上6個(gè)），年通過(guò)能力3436萬(wàn)噸。

浦口港區位于長(cháng)江北岸，自板橋汽渡下1.5千米至石頭河口，港口岸線(xiàn)2.8千米?，F有生產(chǎn)性泊位19個(gè)，年通過(guò)能力1525萬(wàn)噸。

梅子洲港區位于梅子洲左緣上段，規劃遠景預留旅游客運。

下關(guān)港區位于長(cháng)江南岸，自華潤熱電碼頭下至鐵路輪渡碼頭下，功能為客運客渡、生活旅游商貿、休閑觀(guān)光等?，F有生產(chǎn)性泊位14個(gè)，年通過(guò)能力175萬(wàn)噸。

上元門(mén)港區位于長(cháng)江南岸，自鐵路輪渡碼頭下至執法基地下游?，F有生產(chǎn)性泊位10個(gè)（萬(wàn)噸級及以上1個(gè)），年通過(guò)能力349萬(wàn)噸。

南京港依托華東重鎮南京市，交通條件優(yōu)越，擁有水路、公路、鐵路、航空立體交通網(wǎng)絡(luò )。水路外通海洋，辟有至美國、日本、香港、歐洲、東南亞等多個(gè)國家和地區幾十條國際航線(xiàn)；內連長(cháng)江及京杭大運河和眾多支流。鐵路主要由京滬、津浦、滬寧、寧蕪、寧西等多條鐵路干線(xiàn)與全國鐵路網(wǎng)溝通；公路有寧蕪、寧洛、滬蓉、滬陜、長(cháng)深等高速公路過(guò)境，已形成高速及國省干道組成的“對外便捷，干支相連”的交通網(wǎng)絡(luò )；航空可通過(guò)南京祿口國際機場(chǎng)與各地相連，國內航線(xiàn)通往國內各主要城市，國際航線(xiàn)直通日本美國等國家。具備江河、江海、水陸等多種聯(lián)運方式，與世界80多個(gè)國家和地區的160多個(gè)港口建立友好往來(lái)關(guān)系。

港口腹地廣闊，直接經(jīng)濟腹地為江蘇省西部地區（主要是南京市）和安徽省東部地區，間接腹地為長(cháng)江沿線(xiàn)江蘇省、安徽省、江西省、湖北省、湖南省、重慶市、四川省的沿江地區。該地區資源豐富、土地肥沃、氣候溫和、雨量充沛，工農業(yè)生產(chǎn)的基礎條件優(yōu)越，是我國最主要的經(jīng)濟密集帶之一。

南京港擁有長(cháng)江最大的外貿港區、原油港區和煤炭港區；擁有集裝箱、煤炭、礦石、石油、糧食等專(zhuān)業(yè)化碼頭，以及滾裝汽車(chē)、液體化學(xué)品等特種貨物專(zhuān)用碼頭。港口采用了先進(jìn)的通訊導航系統、現代化的計算機信息系統。進(jìn)出港口主要貨種為煤炭、石油及制品、金屬礦石、集裝箱、鋼鐵、化工原料等。2014年全港完成貨物吞吐量2.2億噸（長(cháng)江港口完成2.1億噸），其中外貿吞吐量1974萬(wàn)噸，集裝箱276萬(wàn)標準箱。